Некошерно

Точнее несекьюрно. Дерганье скрипта по крону особой нагрузки не вызывает, особенно, если в самом скрипте предусмотреть проверку на наличие уже запущенной предыдущей копии и выход, если она запущена.
Про конкретную реализацию: apache - это же web-сервер. Я так поняла, что он и не для Вашей задачи запущен и Вы просто должны (по условию) его использовать? Питон - язык программирования, так что с апачем они не конкуренты, просто потому, что их задачи не пересекаются
