[Vadikan]

чтобы был отдельный загрузочный сектор на внешн.жест. ? »

Вам это не нужно. Загрузочный сектор должен быть на внутреннем диске, и желательно на том же разделе, где система - это упростит резервное копирование, в частности создание образа системы.