Vanilla Dragon,
xcalib, утилита командной строки.
Как использовать.
У меня она запускается автоматически после завершения некоторых программ, которые меняют калибровку экрана и не восстанавливают ее после себя, при помощи планировщика nncron (у него есть такой параметр запуска WatchProcStop, т.е. после завершения приложения с заданным именем). Стандартный планировщик такого не умеет (ну или я не знаю как).