[Kiparis]

А если просто нулевую дорожку в нулевом и первом секторах выставить по FF?
Ибо там, вроде, хранятся сведения о всех разделах на винте. Эффект будет почти такой же, как от низкоуровнего форматирования, только времени в десятки раз меньше тратится.