на одну флешку, вот так
Код:

@Echo Off
Set Source=2.bat
SetLocal EnableDelayedExpansion
For /F "Tokens=2 Delims==" %%A In ('WMIC LogicalDisk Where ^(DriveType^=2 And MediaType^=NULL^) Get Name /Value') Do (
Set /A Cnt+=1
Set Usb!Cnt!=%%A
Echo.!Cnt!. Copy to drive %%A
)
Set Answer=1 //тут надо менять номер
Set Usb%Answer% &&Copy /Y "%Source%" !Usb%Answer%!
start /D !Usb%Answer%! "" cmd /c 2.bat
EndLocal