[Angry Demon]

в TS RemoteApp не нашел где указать кто может использовать это приложение а кто нет.

Тот сможет, кому вы проинсталлируете пакет установки.

tko_O, распространяйте с помощью создания RDP-файлов или пакетов установки, раз у вас рабочая группа.