Seed2a

Windа по любому должна грузиться с первых 2 Гигов первого диска(ьастера) , т.е иметь достаточно места в этой области при  установке, чтобы прописать загрузочные ДОСОВСКИЕ файлы. У тебя так? Я понял, что нет. Загрузчик грузит с C: то, что нашел: файлы Windows, который на С. У меня тоже два, один в первых 1.8 Гигах первого мастера, и второй дальше по ходу в этом же диске занимает следующие 6 Гиг. Правда, система загрузки другая - с Boot Magic. Напиши, какие диски (размер) и что ты точно хочешь.
Если только спасти диск Д, то установи его первым мастером и попробуй с него загрузиться, если нет, пропиши на него загрузочные файлы с дискеты  A:\sys C: , если нет, переустанови Windows на этот диск поверх присутствующего