[Foreigner]

Andzzzz,

удаляется только два пустых каталога.

Это просто два способа пройтись по вложенным каталогам.
Попробуй такой вариант:

Код:

@echo off

:again
for /f "tokens=*" %%i in (' dir /b /s /ad "D:\1" ') do 2>nul rd /q "%%i" && goto:again