[zero55]

бэкап виртуальной машины и бэкап почтовика это две разные вещи.
придется делать и то и другое...

когда вы переносите ящик выполняются действия, они записываются в журнал.
Ящики из базы никуда не удаляются, только помечаются на удаление. Для их полного удаления нужно запускать процедуру обслуживания базы.