Необходимо в реестре проверить содержимое разделов startupreg, startupfolder на наличие в них параметров и подразделов, в случае наличия параметров и подразделов, их удалить.
Код:
HKLM\SOFTWARE\Microsoft\Shared Tools\MSConfig\startupreg
HKLM\SOFTWARE\Microsoft\Shared Tools\MSConfig\startupfolder
