Можно кодить с помощью бумажной книги "Гамлет" и передавать почтовыми голубями
)))
А если серьезно, то имеет смысл озвучить требования к платформе, перечню того, какой трафик шифруется, какая полоса пропускания, насколько разделены участники географически и т.п. (что известно). Что из оборудования и софта есть?
А главное озвучьте зачем это делается - т.е. от кого защищаетесь - возможно шифрование окажется не панацеей, а возможно Вам предложат вариант более простой и дешевый.
Кстати, IPSec - это тема... и windows здесь ни к чему, т.к. поддерживается и в Linux.