В NTFS достаточно повредить несколько записей $MFT и считай, что пропали сотни гигабайт --- файлы фрагментированы… Восстановить можно только кусочки, а как их между собой связать...???... --- бездна вариантов…
Да, Get Back Data for ntfs, а также R-Stdio в руки, и ещё терпение при вытягивании файлов на сторону...
ЗЫ Не могли бы Вы детально расписать --- что сделали… Если разбиение сделано стандартно, то MFT начинается примерно c 3.2 GiB от начала раздела, а копия примерно посередине. Так просто NTFS не затрёшь и не убьёшь… Восстановил и скорректировал загрузчик вручную + небольшая правка CHKDSK и файлы за небольшим исключением целёхоньки.. Windows копию загрузочного сектора в последнем секторе раздела хранит. Возможно не ВСЁ так плохо --- возьмите дисковый редактор DMDE/WinHex и посмотрите.
А вот, если Acronis’ом разбивали или Windows 2000, то во втором или четвёртом кластере. Тут *опа…