Как-то так:
Код:

@echo off
setlocal
for /f "tokens=*" %%i in (' dir /b /a D:\Work\Resources ') do call:expand "%%i"
goto:eof
:expand
set "file=%~1"
set "file=%file:~0,-1%_"
if exist "F:\I386\%file%" expand "F:\I386\%file%" "D:\Work\1\temp\%~1"
Я так понимаю, что файлы в i386 имеют расширения вида: .ex_ .dl_ и т.д.