Спасибо. С этим разобрался.
Для теста попробовал пропатчить 1 файл. НО!! сам патч получился ровненько размера патченого файла (т.е. патч не содержит в себе информации для "дописывания" в оригинал, а прост осодержит модиф. файл).. Это лечится?
Проблема за проблемой всплывают...