Странно. У меня в точности до наоборот.
После смены ОС с х32 на х64, полностью прошла данная проблема.
На х32 диск постоянно юзал индексатор поиска.
Частично решил вопрос добавлением в поиск определённых расположений.
Может быть у вас то же самое происходит?
А вообще есть одна краснознамённая гвардейская утилита имени Sysinternals
- ProcessMonitor.
http://technet.microsoft.com/ru-RU/sysinternals
Она вам точно покажет активность файловой системы. Какой процесс к кому/чему обращается.
Попробуйте.
