[kassergey]

Я имею ввиду где они должны лежать на компьютере »

Если загружена XP, то на диске C:\
Если загружена Windows 7, то или на диске C:\, или на скрытом разделе System Reserved

И что должно быть написано в boot.ini? »

В шапке темы же дана ссылка Boot.ini.