[seriych]

caustic,
Вроде бы понятнее не стало. По твоему описанию выходит, что тебе нужен батник, выполняющий команду C:\myscript.vbs <filelist.txt> <filelist2.txt>
Собственно он так и выглядит: C:\myscript.vbs <filelist.txt> <filelist2.txt>
Кликаем на нем и команда выполняется