[Raistlin]

Тут ведь речь, я так понял, не о том, что нет файлов, а о том, что не видит родных драйверов. Т. е. имеет место внезапное несоответствие hardware id (или как оно там называется). А перестановка в другой слот всё лечит. При чем же здесь антивирус.
Я сталкивался с ситуацией, когда встроенная сетевая после очередной перезагрузки определялась как "обнаружено новое устройство", причем родных драйверов не признавала. Еще одна перезагрузка все возвращала в status quo.