[Beyound]

командная строка есть командная строка, она по определению не может исчезнуть, всегда есть родительское окно. Прогресс бар можно реализовать и в командной строке, весь нортон текстовый.. правда правда... и там реализовано все? ascii коды рулят. А если ты про прогресс бар в обычных программа, то что тебе мешает скажем запускать из командной строки запускать программу с прогрессбаром и по некому входному значению изменять этот прогрессбар, сложно но другого способа нет. прогрессбар это элемент dll-ки винды и его просто так нельзя использовать.
А вообще чего ты в конце концов хочешь - если тебе нужно чтото реально красивое и оптимальное может не стоит вообще использовать bat-ы а стоит действительно попробовать auto-it или какой язык программирования попроще, от скриптов это отличается лишь более детальным подходом и большими возможностями.