[nniko]

Да, добавление ненужного модуля в blacklist помогло - он не грузится и комманда lsmod его не показывает. Даже изчезли подкатологи r8169 из /sys/module и /sys/bus/pci/drivers, хотя раньше они были для r8169 и r8101, теперь остались только для r8101.
Но может быть был альтернативный путь, как удалить модуль из автозагрузки, а то получается добавление его в blacklist можно описать аналогией: модуль стучится в закрытую дверь, а ему не открывают (фэйсконтроль не прошел), а как сделать (помимо добавления его в blacklist) чтобы этот модуль даже "не стучался в закрытую дверь", т.е. даже не думал загружаться? Где-то читал, что система определяет какие модули загружать или прочитав файл modprob.conf (если не ошибаюсь) или сканируя на наличие модулей какую-то папку.