При первом соединении skype использует порты 25000 to 40000, в дальнейшем
будет использоваться порты 443, 80.
Вам необходимо посмотреть активные соединения на фаерволе и установить в качестве приемника, не 0.0.0.0:443,
а один или несколько серверов Skype
Почта будет использовать порты SMTP, POP3, IMAP4
DNS
Как я понимаю, базы Касперский обновляет через FTP
http://support.kaspersky.ru/faq/?qid=208639821