Точного источника инфы дать не могу, так как сам видел "то там, то там". По поводу папки $OEM$ :
http://www.oszone.net/2774#q1
Ну а для команд в файлах CMDLINES.TXT, CMDLINES.CMD, RunOnceEx и других файлах CMD или BAT (если они "заточены" под CD-ROM) надо редактировать пути для выполнения.