gora, с приведенным вами файлом конфигураци запускаются как положено две командных строки - одно 32 бит, вторая - 64.
Код:
;!@Install@!UTF-8!
RunProgram="forcenowait:cmd /k Echo This is x86 cmd.exe"
RunProgram="x64:forcenowait:cmd /k Echo This is x64 cmd.exe"
;!@InstallEnd@!
А как подправить данный файл конфигурации чтобы запускался файл run.cmd в скрытом режиме с учетом того какая система, 64 бит или 32 бит?
