Потому что вы не пытаетесь попробовать, а ждете, пока вам разжуют и в рот положат
Да, в ярлыке пропишите в поле Объект
Код:
<путь>\Total Commander\TOTALCMD.EXE "I=e:\my files\имя_файла_общих_настроек.ini" "F="e:\my files\имя_файла_настроек_FTP.ini"
Что такое <путь>, вы должны уже знать.
Но я не понимаю, зачем так извращаться. Намного проще держать настройки в отдельной папке внутри папки с программой, что я и пытаюсь вам объяснить уже второй день
