boroszon, не понял вашей проблемы.
Chudo-V-Periah, как когда-то писал Павел Кравченко aka
Blast в комментариях к утилите FixBootFull - "Утилита варить кофе не умеет". Так же и Multiboot - чудес от нее ждать не нужно: ее назначение в восстановлении загрузчика, не более, + некоторые функции GUI над bcdedit.exe
Почитайте
Восстановление совместной загрузки Windows 7 и Windows XP при переустановке одной из них - это скорее ваш случай.
