Сработает. Файл скрипта можете назвать как угодно и прописать путь к нему в GUI
Дополнительные настройки -
Запуск внешних программ и cmd скриптов. Я такой батник прописываю в секцию
Запустить до процесса интеграции, дабы интегратор не копировал этот "мусор", чтобы потом удалять его .
А вообще лучше из дистрибутива в рабочей папке заранее удалить всё лишнее и тогда и скрипт не нужен будет, и время на все эти операции копирования/удаления при каждом запуске GUI тратится не будет.