А откуда (с какой машины) Вы пытаетесь удалить контроллер домена? И где появляются ошибки?
Если с этого контроллера данные не нужны, то можно удалить (форматнуть винт) на старом контроллере ОС, а из данных AD (в том числе из DNS) действующего контроллера удалить все упоминания о старом КД.
Если на старом КД были какие-либо роли FSMO, то их можно
SEIZE с помощью утилиты ntdsutil.
