Большое спасибо за подсказку. Удалось выделить и сохранить форсированные субтитры. Но вот опять загвоздка, как их вставить в МКВешку? Пробовал с помощью программы mkvmerge GUI, процесс проходит, а сабы не отображаются. Может есть какой другой способ?
P.S. МКВешка у меня кодированная со звуком сразу. Может быть нужно заново кодировать исходные файлы добавляя и субтитры?
Субтитры сохранял в формате SUB\IDX.