Самое малое - двумя способами: или во время того, как отмечаете эти самые чекбоксы, или уже после того как они отмечены-неотмечены пройтись по ним... Может еще кто способов добавит... но поможет ли это вам?
Если нет, то объясните продробнее, что вы делаете и пример вашего скрипта.
