[vadblm]

Возможно у вас стоят суровые настройки энергосбережения, при которых ЖД переходит в режим standby слишком быстро. А просыпается он довольно долго, не минуту конешно, но до 10-20 секунд, да.
Вполне может быть, если не проходите игру в сингле, подгружая уровни раз в 5 минут, а кантерстрайк или подобное рубитесь на одной карте полчаса. И если системе вдруг приспичит обратиться к свопу, то и получится ваша картина.
Попробуйте убрать отключение дисков при не использовании или выставить таймаут побольше (по умолчанию он кажись 20 минут, но может и зависеть от вендора)