1. Честно сказать, ничего не понял, кроме того, что вы какой-то прогой зачем-то "почистили" реестр и с этого момента у вас пошли разные проблемы.

Никакие клинеры никогда не использую и другим не советую. Видел ситуации, когда после подобной "чистки" единственным способом восстановления работоспособности была полная переустановка системы.
2. Имелась в виду пошаговая очередность действий именно в Word. Типа:
- запускаю Word из главного меню - без проблем
- ввожу некий текст - без проблем
- выбираю команду Сохранить - в этот момент происходит то-то...
3. Проблемы наблюдаются только в Word или в других приложениях тоже?
4. Пытались ли выполнить из Word Справка - Найти и восстановить?