Так проблема то есть или нет?

Длительный вход в систему на 99% зависит от настроек сетевых параметров, в частности, DNS сервера. Необходимо проверить, как идет обращение к DNS серверу, например, войдя в систему, выполнить tracert IP_DNS_сервера. Учитывая, что проблема на машине с ISA, вероятно, задан неверный маршрут, который сначала идет во внешку, и только потом опрашивает внутреннюю сеть.