tom2, js/vbs файлы не являются исполняемыми, поэтому и они не исполняются (исполнять их нужно обращаясь к
$SYSDIR\wscript.exe), т.е. команда будет примерно такой:
Код:

$SYSDIR\wscript.exe "$TEMP\MyFile.js"
Это нужно добавлять возможность разделения типа запуска (необходимо добавить возможность "Shell запуск"), тогда будут выполнены действия с типом файла в соответствии с установленными настройками в системе, вот после добавления данной возможности нужно будет указать только путь к js/vbs файлу