Разобрался я, почему у меня не получалось сразу задать сервер обновления через реестр. Код нужной строки в батнике брал здесь, из
этого сообщения. Код строки содержит ошибочное имя параметра. Вместо "UdateUrl" должно быть "UpdateUrl". Когда изменил это значение, то сервер обновления (папка на компе) прописался нормально и обновилось с него прекрасно.
Кстати, в планировщике не нужно ничего менять. Обновляется автоматически планировщиком с нужной папки, заданной через реестр.