[Redew]

1nsider, первый диск вставляйте в КРАСНЫЙ порт, второй в ЧЕРНЫЙ порт, заходите в биос, диски должны быть там видны. Тот, который воткнут в КРАСНЫЙ порт, должен быть МАСТЕРОМ, в ЧЕРНЫЙ - СЛЕЙВОМ.
Windows устанавливайте на диск MASTER, а еще лучше до Windows загрузите Acronis и создайте хотябы один раздел на диске МАСТЕР, сделав его основным и активным, и установите Windows в этот раздел.