[Moandor]

McIntosh, Kolunin скорее всего прав относительно того, что у вас вирь завёлся.
explorer.exe и shell32.dll лучше скопировать с дистрибутива через консоль восстановления.
Можно разводить много полемики относительно того, какой антивирус лучше, но от себя скажу, что avast! имеет замечательную функцию проверки дисков до загрузки ОС.