Я бы первым делом сделал посекторную конию диска, ибо дальнейшие манипуляции могут привести к еще худшим результатам.
Имея копию, можно (я сторонник простых решений) и сhkdsk /f запустить. Он должен восстановить MTF из резервной копии, коя хранится где то в недрах (середине) раздела. Но повторяю, сhkdsk может и еще больший бардак внести. Есть и более "продвинутые" инструменты для этих целей, например,
Stellar Phoenix Windows Data Recovery - Free software downloads and software reviews - CNET Download.com, но они платные.
A лучше послушать кто еще что скажет (а пока копию делать) - способов восстановления немало....