[Sham]

хм... выполнять бекап с помощью скрипта - это самим скриптом формировать дамп нужного содержания, т.е. делать запросы в таблицу, и класть данные в файл в виде запроса INSERT/REPLACE, предварительно положив туда запрос создания самой таблицы и индексов...

примерно такой бекап (с указанным ограничением размера) делает phpmyadmin (можно закачать дамп к себе и посмотреть содержимое). В конце концов можно посмотреть скрипты самого phpmyadmin.

Если таблица большая, то такой скрипт потребует много памяти, и придется делать запросы порциями, либо снимать ограничения (что чревато)...

Подозреваю (не видел), что указанный перл-скрипт использует средства MySQL, и поэтому для его выполнения все-равно нужна привелегия FILE для юзера mysql...