Предположу (тык пальцем в небо) а MySQL тоже работает? Т.к.
SQLConnectInfo ftp@127.0.0.1:3306 ftp ftp
firewall соеденение не блокирует? Попробуйте telnetом приконектиться к порту. Примет ли SQL подключение?
Код:

#
# Alternative authentication frameworks
#
#Include /etc/proftpd/ldap.conf
#Include /etc/proftpd/sql.conf
Я просто выделю, а решать а возможности применения вам. (тоже тык пальцем в небо)
Что означает /etc/proftpd/sql.conf, зачем он нужен, и почему в данном случае он закоментирован? Может вправду не нужен?