[DJ Mogarych]

При захвате были пропущенные кадры (dropped/inserted frames)?

Скорее всего, дело в винчестере. Он у вас на 5400 оборотов, и, возможно, фрагментирован, что создаёт дополнительную нагрузку при захвате и при воспроизведении. Так как поток данных достаточно большой (особенно при HuffYUV), винчестер может просто не поспевать выдавать данные.