[seman]

Возможно в фоне запускается какая-нибудь программа, типа beagle. »

вот это уже близко к истине. поскольку когда я активен в системе - все ок. после простоя - проблемы .
в прицепе - процессы выполняемые на системе. посмотрите плиз, может есть что-то преступное.