Mr dUSHA, спасибо за подсказку.
1. Имел в виду, что эта секция есть в DriverPack_MassStorage_wnt5_x86-32.ini, но ее нет в msst.ini
2. А так все заработало.
Драйверы из папки S5 прописались в msst.ini.
Использую GUI integrator, запускаю в нем файл PrepareMsst.cmd; там по умолчанию ключ -S не прописан, потому и возникла такая проблема.
