[Oleg Krylov]

Все как всегда упирается в проблему настроек DNS. Опишите как у Вас настроены внутренние DNS-серверы. Покажите nslookup <Имя домена> - кроме адресов контроллеров там ничего быть не должно. Куда у Вас указывает SOA-запись? Нет ли случаем записи в DNS типа domain.com указывающей на сайт? Возможно поможет создание записи типа А с пустым именем, указывающей на PDC (таким образом можно сэмулировать SOA)