[Tomset]

Читаете про устройство файловой системы, статей в интернете полно.
Изучаете.
Берете дисковой редактор, я предпочитаю WinHex.
И ищите структуры известных файлов и сами файлы. Корректируете структуры, чтобы правильно ссылались на файлы.
Перед изменениями, делаете резервную посекторную копию всего диска, (или изменяемых структур) на случай собственых ошибок.
Где-то такой план действий.
Конкретно, только видя порушенную файловую систему, можно правильные советы по действиям давать.

У профессиналов по восстановлению данных программы типа DataExtraktor (ломаных нет - не ищите, стоит > 60000р вместе с ремонтным комплексом для HDD)
Такие программы в подобных случаях, помогают строить виртуальный транслятор, что значительно убыстряет процесс.