[TheDestroyer]

Данная конфигурация работала нормально, эффект появился после переустановки windows. Поясню еще: даже если торрент отключить, но запустить параллельно несколько сканеров сети (на основе nmap) эффект тотже.
В свойствах соединения видно, что канал (100 Мбит) используется не более чем на 10%. А вот если посмотреть количество соединений, например, с помощью NetstatViewer, то при достижении примерно 600 подключений начинается данный эффект.
На сервере стоит веб сервер, он доступен из разных сетей через разные интерфейсы. Как только появляется много соединений и проявляется данный эффект, на веб сервер не зайти, даже через другой, совершенно свободный интерфейс.