ну вообще такая бабуйня была на NT/2000. Там система не умела кэшировать файлы при совместной многопользовательской работе по сети. 2003 умеет, может у Вас отключено (не уверен управляемы ли вообще это процесс).
Еще вариант. В конфигураторе пользователям пользователям пропишите рабочий каталог куда нить на рабочей станции (типа C:\Temp)
Еще вариант. Когда один пользователь проводит документ, а другой - тоже пытается проводить документ, то этот второй пользователь загружает сервер непрерывным опросом блокировки. Решение
http://kb.mista.ru/article.php?id=179
А вообще давно изместно, хотите нормальной работы пользователей с 1С используйте терминальный доспут.