Поставь
TrueCrypt
Можешь запаролить всю флешку, но тогда на той машине, куда ты ее втыкаешь, должна стоять TrueCrypt, либо создать на флешке зашифрованный файл-контейнер, а саму TrueCrypt установить на ту-же флешку.
Эта программа монтирует шифрованный файл/раздел как виртуальный диск.
Единственный минус - с правами пользователя вариант с TrueCrypt, установленным на флешке может не сработать - она свой драйвер запускает.
Ну и если забыл пароль, и он не вида "123" - попрощайся с данными