[Oleg Krylov]

Вы когда используете ntdsutil, после команды list domains выберите дочерний домен. И посмотрите что в нем есть вообще. Если там несуществующий сервер, то удаляйте его, затем сайт в котором он был, затем домен. Вот и все. Если нет доступного контроллера в данном домене, а Ваша инфраструктура работает нормально, значит этот дочерний домен Вам не нужен.