Pop-up window parameters
 

а как сделать чтоб окно открулось не с равением по левому верхнему краю а просто посредине либо сверху осредине..?

<a href="index2.htm" target="_blank" onClick="popupWin = window.open(this.href, 'index2', 'location,width=1003,height=595,top=0'); popupWin.focus(); return false;">
перейти на сайт</a>

P.S. И как интегрировать этот HTML отрезочек во флешь? тобишь засунуть под флешь кнопку..

А там ещё есть параметры top и left.

1. Флеш - рыть в сторону FSCommand в мануале все разжовано.
2. узнай размер скрина, подели на 2 - вот тебе и центр.