setfillstyle(1,2);
bar3d(100,100,200,200,20,true);

Я *хочу чтобы Pascal закрасил мне полность этот паралелепипед а не только середи.

Позволяет ли Graph.tpu это сделать???

Нет не позволяет, по текущему шаблону заливается лишь лицевая сторона параллелепипеда.
Мой совет, выкиньте graph.tpu.